Le Conseil fédéral a décidé, le 12 août 2015, de prendre des mesures coercitives à l'encontre de la République du Soudan du Sud et adopté une ordonnance à cet effet. Il applique ainsi la résolution 2206 (2015) du Conseil de sécurité des Nations Unies et les mesures complémentaires adoptées par l’Union européenne le 10 juillet 2014.
Ces mesures sont intervenues en réaction au conflit ethnique, aux graves violations des droits de l'homme ainsi qu'à la crise politique et humanitaire auxquels le Soudan du Sud est confronté depuis décembre 2013.
Le 28 mars 2018, le Conseil fédéral, dans le sillage de l’Union européenne (UE) a étendu les sanctions à l’encontre de la République du Soudan du Sud et soumis trois personnes aux sanctions financières et de voyage. Avec la modification de l’ordonnance du 30 novembre, les dispositions de l’embargo sur les biens d’équipement militaire ont été adaptées conformément aux décisions du Conseil de sécurité des Nations Unies.