Le Conseil fédéral a décidé, le 1er juin 2012, de prendre des mesures coercitives à l'encontre de la Guinée-Bissau et adopté une ordonnance à cet effet. Il applique ainsi la résolution 2048 (2012) du Conseil de sécurité des Nations Unies et les mesures complémentaires adoptées par l’Union européenne le 31 mai 2012.
Ces mesures sont intervenues en raison de la violation de l’ordre constitutionnel et des droits démocratiques suite au coup d’Etat du 12 avril 2012.